父親の「曲がった事をしてはならぬ！つねにまっすぐな心で行動しろ！！」の教えに純粋に従う直角は家の柱や庭の石…何でも直角にしてしまう。その直角が身分が高い家柄の子供がいる萩明倫館に通う事になった。…波乱が巻き起こる予感！！直角の行動は見逃せません。

独自の「直角斬り」で乱暴者の月形を破り、人気者になった直角。先輩・郷から、転校生・瞳凛太郎に「学校つぶし」のうわさがあることをきいた直角は…。そして、城代家老は、直角の大きな力で学園の危機を救おうと考え、直角を城内に閉じ込めた。

大門学園で開かれた武芸大会に、直角と郷は明倫館代表としてのりこんだ。直角は「直角斬り」で、あっという間に十数人を打ち破る。とうとう相手は、大門学園主将・斎門ただ一人だけになった。しかし、斎門の一撃が直角の胴に…。

長崎帰りの北条照正は、身分の低い直角に人気が集中するのが気に入らない。照正の許婚者（？）・貴杉じゅんは直角の興味を示しはじめ、直角に会いたい一心で、女だけの集まりである指月（しづき）剣道部を率いて直角たちに挑戦してきた。

直角は勉強重点の明倫館に、「真の武士道精神を！」と大ハッスルの毎日。そして、直角に好意を持つ名門家の娘・じゅんの提案で、剣道部全員がお金を出しあい、自分たちの道場をつくることになった。しかし、直角ひとりだけお金がなくて…。

石垣直角は、明倫館の名物男。一報、北条照正は、直角の人気に負けじと、あの手この手で悪戦苦闘。そんな照正を案ずる城代は、直角に、照正と、友だちになるよう、たのみこむ。城代の期待にこたえるべく、直角は照正への大接近をはじめた。そしてついに、照正を、石垣家に招待すること成功。が、はじめて暖かい家庭の雰囲気にふれた照正は、大ショック。さびしそうな照正を見て、直角は真の友達になろうと、心に誓う。

照正は、直角、郷、拓馬の三人をご学友に選び、寝食を共にさせる。ご学友の地位を独り占めしようとする拓馬は、あくどいたくらみで直角を陥れようとする。だが、直角の大活躍で拓馬のたくらみは破れ、照正との間に友情が芽生えはじめる。

直角と照正の二人は、上級生となるための進級試験を目前に控えていた。成績のよくない直角と照正を案じた郷は、二人に対し徹夜の猛勉強を開始する。しかし、試験当日の朝、直角と照正は後輩たちにだまされ、決闘に出かけてしまう。

直角と照正は、無事二年生に進級し、新学期をむかえた。最上級生になった郷は、明倫館に生徒会をつくり、生徒会長を選挙で決定しようと提案する。郷の推薦を受けた直角、打倒・直角を目指す照正、一年生の大山大介の三人が立候補する。

直角対照正の選挙戦の結果は、直角が見事生徒会長に当選した。おかげでやっと仲良くなった二人の間は逆戻り。直角は他藩との親善を深めようと、隣藩の城西校と純心良妻女学校にでかけた。しかし、城西では石山剣道部長や部員たちと大乱闘になってしまい…。