保健室の校医が主人公の人気作「放課後カルテ」の単行本未収録特別編がついに登場！　小学校を卒業した水本羽菜が通う中学校。不登校の少年、そして、子供たちに「居場所」を提供する「子ども文庫」の役割とは…。牧野先生も登場の分冊版81巻、特別編後編。

成長する子どもたちと牧野がふたたび出会う！　病院に戻った牧野は多忙な日々を送っているが、かつての児童は小学校を卒業して中学――やがて高校へと進学していた。牧野を悩ませていた少女の啓も弟とともに医者になる夢を抱き、勉強に邁進する毎日を送っているが……。一方、牧野は病院である問題少年に出会うが！？

成長する子どもたちと牧野がふたたび出会う！　病院に戻った牧野は多忙な日々を送っているが、かつての児童は小学校を卒業して中学――やがて高校へと進学していた。入退院を繰り返し未来が見えなくなっている秋月悠馬。牧野に憧れて医者になりたい啓は、それぞれの葛藤を抱きながら前進の1歩を進めるが……。

病院に戻り小児科医として忙しく働く牧野は、退院を目前に控えた小2の花乃（かの）ちゃんから１通の謎の招待状をもらう。それは牧野がかつて赴任していた小学校に復学する花乃の複雑な気持ちを表すもので…！？SPドラマ「放課後カルテ　2025秋」放送記念！番外編＜前編＞

高2になった水本羽菜は家の事情を慮って自分の進路を決められないでいたが、なんとか決心し進路調査票を提出する。自分のこと・自分のしたいことを考えると頭と心が混乱してしまう羽菜。そんなとき友達らと入ったバーガーショップで偶然、藤野一希と再会。じつは二人には、ある事柄からわだかまりが生じていた…！SPドラマ「放課後カルテ　2025秋」放送記念！番外編＜後編＞