水華魅（みかみ）とエクセル。共に大切なパートナーを失った深い傷を持つ二人の女に、獅子神（ししがみ）一族の刺客が迫る…！ クロと慶太。自らの限界を打ち破るため、同期（シンクロ）率を高めるための修行に励むが、光明の見えぬまま、再び強敵と相まみえる事に…！ 元神霊（もとつみたま）と契約者、闘いの中で試されるふたつの『絆』──!!。

クロと慶太を襲った絶体絶命の危機――！ 不完全な二人だからこそ、運命が互いを引き合わせ、無限の可能性を与えたのではないか…。英霊たちの魂に導かれ、クロと慶太の同期（シンクロ）は新次元へと翔け昇ってゆく──!!

獅子神（ししがみ）四天王の一人、仮面の男・ゴーストの恐るべき策謀は、東京の元神霊（もとつみたま）たちを混沌に陥れていく…。兄・黎真（れいしん）への唯一の手がかりを求め、クロたちは厳格な掟に生きる紫龍（しりゅう）一族の里を訪ねるが――!?

異様なまでに人間を毛嫌いする紫龍（しりゅう）一族の舞凪（マナ）。その原因は、かつて一族を出奔した実の姉にあった。帝龍流（ていりゅうりゅう）後継者の地位を捨て、人間との愛に殉じた最強の拳士・優凪（ユナ）の悲しき物語とは――!? ナムの過去を綴った特別編『another story of 黒神 2nd』も収録!!

紫龍（しりゅう）一族の姫・優凪（ユナ）の忘れ形見が獅子神（ししがみ）の部下・海焔（カイエン）に誘拐された。舞凪は、一族を出奔した姉への整理し切れない思いを胸に、甥・勇司（ゆうじ）を救出するため、一味のアジトに向かう。そこで彼女が自ら心に刻み込んだ、人間と元神霊とを繋ぐ絆とは──!? 茜（あかね）さんがお見合いする『茜さんのデート』・ドキドキムフフ『銭湯に行きましょう！』の特別編をダブル収録!!

ゴーストの企み。嗤苑（しおん）の圧倒的な力。しかしクロは「真性元神霊（しんせいもとつみたま）」の言葉に反応、封印された謎の記憶とともに、その激烈なる真の力を覚醒させた！　増刊YGに掲載された水華魅（みかみ）の「おっぱい」VS.エクセルの「ちっぱい」対決外伝、『北風と太陽』も収録！

上古の世、この星を管理した種族『真性（しんせい）』。その出来そこないである女神・サウザンドは、いにしえの人類『武器の部族』の男・ヴィーナと出会い、愛を育み、『元神霊（もとつみたま）』の祖となる子をなした…。クロの血に秘められた『真性大戦』の記憶が明らかに！　元神霊と人類の始まりを描く『太古編』を完全収録した第17巻!!

『真性（しんせい）』『元神霊（もとつみたま）』そして『人類』…。積み重なったこの星の歴史の最先端「現在」に生きる慶太（けいた）とクロは全てを識（し）り、進むべき道をついに定めた。全人類の３分の２を滅ぼす悪魔の計画『新聖地開闢計画（ギ・ティス・エバンゲリアス）』を阻止し、兄・黎真（れいしん）を止めるため、樹海に隠された自分の故郷、獅子神（ししがみ）一族の『清き処』に向かうクロ！　最終決戦の幕が開く第18巻!!

富士の樹海に隠された獅子神（ししがみ）一族の『清き処（きよきところ）』。中心に座する磐座（いわくら）『核なる霊石』はサウザンドの化身、彼女自身がその身を変じ、古（いにしえ）の神々『真性（しんせい）』三柱を封じたものだった……。ついに甦り、全人類を滅ぼさんとする『真性』。慶太とクロの最後の戦いが始まる。富士山の大噴火は阻止できるのか!?　そしてクロと慶太の運命は……!?