オレの名は工藤新一、ちょっとは名の知れた高校生探偵…だったはずなのに!?　気がつけば、いつの間にやら小学生に逆戻り。子供の姿でも頭は大人、小っちゃいなりに難事件を解決だ！　なんたって真実は、いつもたった一つなんだから!!

オレの名は江戸川コナン。だけど、本当の姿は高校生探偵工藤新一さ。オレを子供の姿にした黒ずくめの男たち、せっかく奴らを見つけたのに…。お次は大阪からまたまたアイツがやって来た！　何かイヤな予感がするんだな…。

本当は楽しい高校生活がオレを待っていたはずなのに。実際のところは…血なまぐさい殺人事件ばっかりが、オレの心を悩ませる!?　甘い恋の悩みなんてのが、あって当然なんだけど…。おっと蘭ねえちゃん、どこ行くの!?

正体隠して探偵稼業。何とか事件は解決できてはいるけれど、そろそろ蘭も怪しんでるに違いない!?　だけど、だけど…コナンが工藤新一だなんてこと、やっぱり誰にも言えないぜ!!

コンサート会場でカンケリ遊び!?　そこでTWO-MIXの高山みなみちゃんと遭遇だ！　ところがここから事件発生！　みなみちゃんが誰かにさらわれた!!　またもや少年探偵団にかり出されちまった…。でも、彼女の声、誰かに似てる…!?

今回の事件は本当に参った…。みんなは待ってたかもしれないが、オレにとっちゃ実に厄介な相手だったぜ…。とにかく、怪盗VS名探偵の大勝負、じっくり楽しんでもらおうか!!

真夏の海で何かが起こる!?　いろんな人のいろんな思惑が絡み合い、灼熱の太陽が照りつけるなか、誰かの身に危険が迫る…。真実を海の中に逃がさぬように、コナンが殺意をあぶりだす!!

奇妙な転校生がやってきた…。なんとオレの正体が新一だって知ってるぞ！　一体こいつは何者なんだ!?　同時にニセ札事件も発生だ！　敵か味方か、見当もつかない謎の少女…奴の本当の名前は何!?

平次に誘われ大阪へ。のんびり食い倒れを楽しむはずが、殺人事件に巻き込まれ、大阪の街を西へ東へ大移動!!　こんな形で観光することになったけど、平次のルーツをしっかり見たぞ!!

不気味な洋館に迷い込み、オレは不覚にも背後から!?　これじゃあ事件の解決どころか、オレの命まで危ないぜ!!　でも、こんな時こそ頼りになるのは、やっぱりいつもの仲間だぜ!!