かつて九郎が倒した外国人テロリストのアレクセイら外商部隊の二人と遭遇した十郎と竜虎。鈴木の陽動作戦にまんまと引っかかり、NINのエゴ田のアジトに侵入してしまった五十嵐と、その背後にいるであろう加藤を討伐するため４人と猫１匹は行動を共にすることに。一方、アジトであるエコエコタワーの最上階では、小説家の吉田がNINの活躍を宣伝する動画配信者になるため鈴木にしごかれていた。

UNに寝返ったと思われた加藤の本当の目的は、NINの頂点にいる「果心居士」を倒すことであり、そのために敵同士であるUNと十郎たちNINの下忍を共闘させようとしていた。「近日中にUNと会う」と言い残し、加藤はまた姿をくらませる。一方、練魔のアパートにいる十二郎のもとには新しい忍務を伝えに手負いの日比がやってくる。日比はラップに乗せてNINの重要な情報を漏らしていくのだった。

NINの世代交代を画策し、七人衆の一人・千代女を殺そうとするネオ七人衆。予想外の強さに苦戦するも十郎が現れ、ネオ七人衆側に加勢する。さらに、一枚岩と思われたUNも、NINの下忍との共闘を受け入れられない一郎が反旗を翻す事態に。一方、暇潰しに大野さんと将棋ならぬ「忍棋」の最中の十二郎。その十二郎に会いにアパートにやってきた野口は、謎に包まれたアパートの大家さんらしき住人と遭遇するのだった。

全忍者待望、2025年1月24日(金)実写映画上映開始！　『アイアムアヒーロー』花沢健吾が描く現代忍者奇譚第１４巻！！アパートの部屋から、忍者が作った地下壕に降りた十二郎と野口。少し奥まで行ったところで十二郎が道に迷ってしまい二人で途方に暮れていると、七人衆の一人の翁が現れる。一方、地上ではUNの禍山から接触された竜虎が自分の身の振り方に迷っていた。そんな竜虎のもとに嶋田と小峠がやってきて、中忍への昇忍を餌に情報を渡せと迫る。魅力的な中忍の特権と嶋田の脅しに竜虎が揺れる中、UNの接近を報せる「Nアラート」が鳴り響く‥‥。

全忍者は観た！　あなたは！？　祝・実写映画ロングヒット！！　『アイアムアヒーロー』花沢健吾が描く現代忍者奇譚第１５巻！！UNによるNIN襲撃は嶋田から噴出された毒ガスで強制的に全員退避となり、ともに痛手を負って終わった。十二郎と野口が七人衆の一人との話を切り上げ地上にあがると、毒ガス事件で大騒ぎになっており、さらに誰かの思惑か「事件を制圧したのはNINである」とニュースで政府が発表、ついに忍者の存在が公になる。そんな歴史的三者会談を明日に控えて様々な思惑が交錯する夜、双子のくノ一は仲間の仇である五十嵐と決着をつけようとしていた。