起きた戦は止められない。ならば……。民の犠牲を見過ごせない漂太（義経）の才覚に目を向けた、頼朝軍随一の実力者・上総介広常は、漂太に何を語る？　そして源氏第三の男、剛勇をうたわれる源義仲、立つ！　越後の平家方との戦いを、圧倒的不利を覆して撃破した義仲の勇名は北陸道諸国に轟き渡る。危惧した頼朝は、同族・義仲を討伐せんと動き始める。漂太は源氏同士の争いを止める為、自ら使者となって義仲の下に向かうが!?

頼朝対義仲、同じ源氏同士が一触即発の状況下で、争いを収めるため使者となり敵の本陣へ入った漂太（義経）。だが、説得には失敗し、計らずも総大将・義仲の嫡男をさらい出してしまう。義仲の逆鱗に触れ、緊迫する両軍。合戦は避けられないのか――!?　そして、頼朝から漂太に、まさかの“結婚命令”が下る！　突然の厳命に戸惑う漂太は!?　静御前（りん）とかすみ、戦乱の世に咲く花二輪と時代の寵児。その恋の行方は……。

頼朝の厳命に従い、漂太（義経）が妻を娶り、鎌倉にはひと時の平和が訪れた。――だがその一方、倶利伽羅（くりから）峠では、源義仲と平家十万の兵達が相対していた……！　平家軍の総大将は平維盛（これもり）。富士川の合戦での不始末以来、軽んじられてきた汚名挽回と、義仲の首を狙い、十万の軍勢を連ね北陸道を攻め上がる。歴史を揺るがす大軍（おおいくさ）が始まる──!!　いよいよ源平の運命が大きく動く!!

栄華を極めた平家一門が、義仲の攻めを恐れ、都を捨て西国へ逃げてゆく！　歴史の流れは大きく変わりつつあった。一方、源氏同族の争いを避ける為、義仲の上洛を止めようと比叡山に入った漂太（義経）。しかし、時既に遅く、義仲は強力な後ろ盾となる後白河法皇を手中にしていた……。上洛を果たした義仲が、更なる野望を燃やす陰で、無頼の徒と化した木曽兵が京の民を苦しめる。そんな時、謎の獅子面が現れ木曽兵を蹴散らす!?

都落ちした平家が逆襲を開始した！　西国で力を盛り返し、都を目指し攻め上がる平家軍――。御所に立て籠もる法王は、義仲に平家追討の命を下す。瀬戸・水島で義仲を迎え撃つのは、平知盛・教経の大船団。船戦（ふないくさ）の行方は……!?　　そして義仲は、京で法皇を脅して頼朝追討令を出させる。そんな義仲に対し、頼朝は立ち上がる決意を固めた。搦（から）め手総大将として、漂太（義経）の戦が、今、始まる!!

後白河法皇を脅し、「征夷大将軍」と「頼朝追討令」を手に入れた義仲に対し、頼朝が立ち上がった！　搦（から）め手の総大将は漂太（義経）――。緒戦“宇治川の戦い”では、民の家々を焼いて煙幕を張り、一気に川を渡って攻め込んだ義経の奇策により、木曾軍は蹴散らされた。そして、六条河原での合戦の中、“一騎打ちの名乗り”を挙げる義仲に対し、漂太はこれを受けて立つ！　いざ尋常に勝負……!!

義仲、討たれる──。漂太（義経）は搦（から）め手の総大将として木曾軍を蹴散らし、“宇治川の戦い”に勝利を収めた。だが、源氏同士の合戦の間に平家が息を吹き返す！　再び搦（から）め手の総大将となった漂太は、京へ戻り、本物の牛若の実家を訪れる。牛若の魂を継ぐ者として、いよいよその悲願・平家討伐を果たす時が来たと告げに……！　「智の者　峨山直平」を加えた最強の郎党を従え、漂太、いざ源平決戦の地へ……!!

源平の命運が懸かる一大決戦を明朝に控え、険しい山で迷った漂太（義経）一行。山中の民家で、ワッシー（鷲尾三郎）という道案内を得るも、その道は危険に満ちた断崖の小道。漂太たちは間に合うのか……!?　歴史上、世に名高い源平合戦の「一の谷の戦い」が、今、始まろうとしていた！　平家城郭・一の谷城を見下ろす絶崖の上に辿り着き、源氏不利の戦況を見てとった漂太は、目の前の断崖絶壁を馬で駆け降りると宣言する!?

自らの命を顧みず、断崖絶壁を騎馬で駆け降りた漂太（義経）達！　この一の谷城急襲で、平家軍優勢の戦況は一変、源氏軍の優勢は決定的なものになる。搦（から）め手・塩屋は陥落、平忠度は討たれ、清盛の五男・平重衡を生け捕りにされ、平家軍は逃亡を始める。勢いに乗る漂太たちは、福原の地で平家の知将・平知盛を追い詰める……！　歴史に名高き“一の谷合戦”ここに決着!!　一方、頼朝と漂太の兄弟間の絆には暗雲が……？

頼朝と漂太（義経）の兄弟間の絆に綻び、そして暗雲が!?　京の都に戻った漂太の元に不穏な噂が届く。北条時政の進言で、源義仲の遺児・義高が頼朝の命により殺されるという。生前の義仲に義高を託された義経は、義高の鎌倉脱出を画策する。漂太の命を受け、鎌倉へやって来たかすみは、先に潜り込んでいた巴御前とともに義高を救うと誓うのだが……!?　鎌倉で、そして京で、頼朝と漂太を反目させようとする思惑がうごめく！