「本家よりも萌える？」赤松健先生推薦!!　TVアニメ版「ネギま!?」をコミカライズ!!　10歳の少年、ネギ・スプリングフィールド。魔法使いの修業のため、女子中学生たちの先生をすることに！　はたしてネギは立派な魔法使いになれるのか？　ドキドキの学園生活が今はじまる!!　ネギとアーニャが通ったイギリスの魔法学校時代のエピソードも完全収録!!

魔法使いの修業のために、女子中学生たちの先生をするネギ・スプリングフィールド。個性的な生徒達との刺激的な毎日に黒い影が忍び寄る!?　大人気の近衛木乃香（このえ・このか）＆桜咲刹那（さくらざき・せつな）のエピソードや、アーニャ来日編など超充実の内容でお届けしま～す!!

女子中学生たちの先生をするネギに襲いくる謎の妖精！　ネギは大切な生徒を守りきれるのか!?　あの手この手で襲ってくる妖精たちの襲撃に、ネギは「もっと強くなりたい」と願う。エヴァンジェリンに弟子入りしたネギは、必死に修業に励む。大切な人を守るため、もっともっと強く……。そこに襲いくるゴーレムと妖精！　ネギはみんなの力を借りて敵に挑む！　しかし敵の正体は……!?

無事、3年生に進級したネギ担任のA組！　更に、ネギの幼なじみ・アーニャも転入してきて、ますますにぎやかでパワフルなクラスに!!　そして、アーニャが早く学校になじむように、部活に入ってもらおうとネギは計画。新体操に、料理、茶道と色々見学するものの、やっぱり部活には入らないと宣言するアーニャ。そこに現れた楓（かえで）と鳴滝（なるたき）姉妹は、自分達の「さんぽ部」にアーニャを勧誘するが……!?

中間テストも無事（？）終わって雪広（ゆきひろ）財閥のリゾートアイランドで思いっきり遊ぶネギと3-Aメンバー!!　これを機会に仲良くなろうと、ネギはみんなからひっぱりだこ♪　みんなのラブラブモードに気付いたハルナは、とある作戦を思いつく！　それに踊らされるいいんちょや、のどか達は大変なことに巻き込まれ……!!

師匠・エヴァンジェリンに、父親・ナギのことを尋ねたネギ。それを聞いたエヴァは、魔法を使って自分の記憶の世界に、ネギを入り込ませる。そこでは、ナギとエヴァの出会いや、旅先の村で起こったことなど、ネギの知らなかった父親の姿が次々と見えてきた!!

大好きな高畑（たかはた）先生が学園から去り ちょっぴり元気のないアスナ。そんな彼女の前に現れたのは、幼少時代、結婚の約束をした王子様!?　それを見たネギは、内心フクザツで……!?　『ネギま!? neo』大団円！　3-Aのみんなの恋心の行方は――!?