スティグマが創造した「ネヴァーランド」で、ヒーローたちはアマラリルクとの死闘に身を投じていた。中国代表のミェンロンは、因縁の相手・ドキとの再戦に挑む!! 怒りの感情に支配され思うように戦えないミェンロンは、記憶の中で母親と邂逅し…？

スティグマが作り上げた国、“永遠の国”が出現し、侵食されてゆく世界。中国のヒーローであるミェンロンは、アマラリルク・ドキとの激闘に身を投じ勝利をおさめた。一方、スティグマの思惑は“永遠の国・第二幕”へと突入。『創転心』を克服し復活した新生シャイが挑む！！ ところが、シャイの中学校にアマラリルクのセキララが転入してきて同じクラスに!? 学校を舞台にアマラリルクが強襲し、波乱の新章へ――！！

中学校を舞台にアマラリルクの強敵ルイズ、メンドゥーサと交戦するシャイ。劣勢の中インドのヒーローであるニルヴァーナが駆け付け、戦況は最終局面へ!!そして、シャイは「シャインの死の真実」に迫るため調査を開始。中学校に存在するシャインの手がかりは、彼女が描いた「絵本」で…!?

シャイは中学校を舞台に、アマラリルクのルイズ、メンドゥーサと交戦。最強のヒーローのひとり、ニルヴァーナとの共闘で、激戦は最終局面へ!! そしてシャイは、姉であるシャインの調査を開始する。校内で発見した不可解な「絵本」が紡ぐ、衝撃の過去とは…!?

スティグマらアマラリルクの潜伏先を知ったシャイは、フィンランドのヒーロー・ハルティアとともに潜入作戦を開始。攫われた祖父と転心輪を奪還するため、アマラリルクのメンドゥーサとの激闘に身を投じていく…!!

シャイは老願寺で、祖父の紅葉山陽と対峙。彼の転心能力により、別世界へと意識が飛ばされたシャイは、現実に戻ってこられるのか…!? 一方、フィンランドのヒーロー・ハルティアは、アマラリルクのメンドゥーサと交戦。メンドゥーサの過去、そして願いが明かされる…!!

シャイは日本で活躍する、「恥ずかしがり屋」の異色ヒーロー! この世を混乱の渦に陥れる、アマラリルクから世界を救えるか…!? 別世界へと連れ去られていたシャイだったが、祖父と約束を交わし現世に帰還。だが世界は、ルイズ率いる各国の“偽者”ヒーローにより大混乱に…！ そんな中、偽ハルティアの前に立ちはだかったのはなんと…アマラリルクであるはずの、タルムー・メンドゥーサだった！

ネヴァーランドに捕らわれたシャイ！はたして世界は誰が救うのか……!? シャイの“偽者”が世界で暗躍。ヒーローを装い、悪事を働く中アマラリルクたちの拠点・ネヴァーランドが突如、月鏡湖から大空へと飛び立った。そんな中、その足跡を追うのは…なんと、テルの友人、小石川イコだった！

シャイを救うべく、ネヴァーランドに乗り込んだイコと曖！待ち構えるクフフさんの策謀により、ゲームの世界へと引きずり込まれてしまう。イコは両親を失った過去のトラウマに打ち勝ち、シャイを救うことはできるのか…!!そして、セキララとの直接対決へ――!!

ネヴァーランド、月に向かって飛翔!! アマラリルクを止めるべくネヴァーランド内に侵入したヒーロー陣営。シャイは因縁のルイズと再び対峙し、戦いの舞台はついに宇宙へ!! 一方、スピリッツたちに自らの過去を打ち明けるクフフさん。ヒーロー・シャインとの関係が明らかに…!!