取り潰し寸前の紅緒の生家・化野家で、新生活を開始したろくろ。化野家の再興を心に誓う式神・きなこの指南で、悠斗討伐への足がかり“御前試合”を目指す事に。青陽院に入学し仲間探しを始めるが!?　一方、呪力を取り戻すため、紅緒は孤独な戦いの途へ…!!

土御門島を熱狂の渦に巻き込む御前試合がいよいよ開幕！　家の威信を懸け、熱き戦いの火蓋は切られた！　天若家を背負う繭良は、勇気を奮い立たせ、御幣島すばるに挑むも、その力の差に圧倒される…。一方、胸を昂らせるろくろは、格上・勘久郎との戦いへ――。

御前試合、水度坂勘久郎との対戦は、ろくろが投げかけた「勘ちゃん先生」の言葉で一変!!　マスクを外し素顔をさらけ出した勘久郎は“ケガレ喰い”の封印を解き、ついに本気を見せる！　残り時間はあと僅か。驚異的な強さの勘久郎に、ろくろが選んだ最後の一手は!?

御前試合の最終戦、十二天将最強と謳われるうの宮天馬を前に、互角の戦いを見せる斑鳩士門！　だが、追い込まれた天馬は突如豹変、ろくろ達は、信じがたい結末を目にする!!　一方、本土に残る紅緒は、呪力を取り戻すため、神威の案内で謎の婆娑羅・千怒の下へ…!!

再び、ろくろの元へ戻るため、残酷な儀式に身を委ねる紅緒。追随する神威にも異変が…!?　一方、“石鏡悠斗討拔作戦”に抜擢されたろくろ。焔魔堂家を率い、意気揚々と任務へ挑むも、陰陽連へ戦慄の知らせが!!　脅威度SS婆娑羅出現、緊急事態発生に緊張が走る!!

婆娑羅・加布羅に急襲された五百蔵家！　単身立ち向かう志鶴の元に駆けつけた膳所美玖と蹉ダ桜。加布羅は二人の仇敵でもあった。死力を尽くし戦う三人に非情な運命が!!　一方、ろくろ達の前には、婆娑羅・銀鏡が立ちはだかる！　焔魔堂家一同に動揺が拡がり…!?

婆娑羅による五点同時襲撃に晒される陰陽連。焔魔堂家を率い、銀鏡と対峙するろくろもその渦中に…。そしてついに全ての元凶、石鏡悠斗が真層・禍野最上階層に現れる！　迎撃に向かう陰陽頭・土御門有馬。だが、婆娑羅二位・無悪との対峙は未曾有の事態に…!!

土御門島の結界消滅！　現へケガレの軍勢が放たれた…！　禍野で戦うろくろと有主は、救出に来た陰陽頭・有馬が、婆娑羅・無悪に倒される信じ難い現実に直面し、為す術を失う。だが、有馬は呪力を繋ぎ復活。無悪と再び対峙するため、最後の禁忌を破る――!!

脅威度SSS（リスクトリプルエス）、更に“玄胎”と化した悠斗が、ろくろと天馬を追い詰める。だが二人が手を取り合った瞬間、“共振（レゾナンス）”が発動、反撃に転じるが――!!　千年続く陰陽師とケガレの戦いは、終焉の始まりへ…。幼き日、天馬が背負った宿命、そして悠斗を襲った悪夢とは…!?

新たな誓いを胸に、双星の陰陽師として宿敵・悠斗に挑むろくろと紅緒。悠斗との最終決着へ死力を尽くす！　一方、繭良たちの参戦を機に婆娑羅同時襲撃は終熄へ。試練を乗り越え陰陽連は再始動するが、紅緒はろくろに伝えなければならない真実の告白があった…。