ニューヨークでコースケの事件に関わったことで忘れていた記憶が呼び起こされたおっこは、過去に不良グループ【千刃鶴】の一員として活動していた罰を受けずにいたことへの自責の念に支配されていた。他のメンバー同様に自分も罰を受けなければいけないと、誰にも別れを告げずに地元へ帰ってしまい、そこで昔の仲間と出会い、不良に絡まれてしまう。唯里は理恵と乙女と共に日本へ駆け付け、健太とも偶然落ち合った。そして四人はおっこが向かったであろう千刃鶴の元アジトの廃工場へ向かうのであった。

過去の辛い記憶を取り戻しニューヨーク校を去ろうと日本へ帰ってしまったおっこ。その後を追った唯里、理恵、乙女の三人は途中偶然にも健太と合流し、四人でおっこを連れ戻しに向かい、無事説得することに成功した。健太はおっことニューヨーク校を一緒に卒業する約束をし、おっこの気持ちも聞いてしまう。その後おっこは無事ニューヨークへと帰りつき、迎え入れられた。健太は一人実家に戻り、未来に思いを馳せながら因縁に決着を付けようと父親と対峙するのだった。

心の奥底に押し込めていた記憶を取り戻したおっこが学校を去り、一時は平穏が崩れかけたニューヨーク校だったが、唯里と健太達の尽力により再び平穏を取り戻していた。しかし間もなく迎えた冬休み、健太は実家へ戻るとあられもない姿にされている父親の姿を目撃することになる。それをやったのは鬼ヶ原京平太、かつて姉の笑美里の許婚だった男だった。健太は底知れぬ恐怖を抱え一人稽古に打ち込んでいると、自らの許婚の母の優乃さんから鬼ヶ原という家のことについて話を聞かされることになったのだが…

父が対峙している鬼ヶ原という底知れぬ悪を知った健太は、何等かの意図をもってニューヨーク校に送り込まれたかもしれない八人の生徒がいることを知り学校へと戻った。しかしその内の一人の天草千代に接触してみるも鬼ヶ原の影を感じることはできず、徒労に終わる。優乃により事情を共有された寮監達の支援を取り付けた健太は、八人の内の一人、恩人であり特別なパートナーでもあるおっこに二人きりで話を聞くべく出かける約束をするのだが…そこに波乱を呼ぶ一人の少女の影が近づいて来ているのだった。

冬休みが明け二学期となったニューヨーク校にかつておっこの知り合いだった綾が転校生として訪れ、理恵と離れ離れになっていた父が研修生として訪れるなど、新たな面々が顔を出す中、 遂には死んだ筈だった唯里の姉を名乗る柳瀬優樹子までが突如として現れた。ある日置き去りにされた唯里を保護したという認識を持つ健太と真っ向から対立し拳を交える優樹子と健太。そしてそれを仲裁しようと割って入って来る事務員、エレナ。どこまでが仕組まれたことなのか、健太と唯里の運命の歯車が動き出していた。

京平太によるバースデーパーティーの前座が予告される中、死んだと思われていた唯里の姉が訪れるなど、加速する非日常の中で健太は少しでも不測の事態に対処できるよう鍛錬の日々を送っていた。一方で唯里とおっこは理恵が経験した辛い過去の出来事を共有することになり、かつて心が壊れてしまった理恵の父親がもしかしたら新たに研修生として赴任してきた間宮先生かもしれないということを知る。壮絶な過去を知った二人は理恵が未来へ進むために間宮先生の素性を確認するべく美術室へ向かうのだった。

優樹子は自分が今までどのような人生を歩んで来たかを健太に語り始めた。柳瀬家が唯里を置き去りにした直後、優樹子もまた異世界に迷い込んだような遠くの地で目を覚まし、苦しんでいたという。唯里の存在を頑なに認めない両親に憎しみを抱くようになった優樹子は一人家を飛び出し、遭難の末に浅羽という夫婦の下に辿り着く。浅羽の夫婦は優樹子のことを行方不明になっていた娘と勘違いし、優樹子も真実を言えずに日々を過ごしていた。しかしそんな日々は長く続かず、優樹子の前に両親が現れたのであった。