一九一〇年代。陸軍直属・栖鳳中学に通う岩元胡堂は、軍の訓令により、全国各地の超常現象を調査していた。“黒い雪”が降ると噂される村で、出会った特殊な力を持つ少年…。能力を病気だと思いこむ少年に、使い途を示した岩元は自分との共通点を告げ、彼に学園の推薦状を差し出す――。訪れた任務先で、岩元を待ち受ける様々な怪奇（であい）。彼らの時代を解き明かす、浪漫奇譚開幕!!

傷を負ったと噂の美しき女優。彼女に隠された秘密を解き明かす為、任務へ赴いた岩元は、不本意ながら原町・天羽と行動することに…。さらに、能力者による事件が起き原因を“討伐せよ”との伝令が入る。大量の死傷者が出ているとの情報から岩元は、またしても原町達を連れ、現場へと急行する！　悲惨な事件の向こうに待ち受ける新たな敵、その目的とは――!?

“物体を複製できる能力者”を狙う英国魔女軍団を阻止するため、仏像が跋扈する森へ赴いた岩元たち。しかし、先手を打たれ、未知なる能力を前に翻弄される。反撃を開始するが、英国の援軍による容赦ない猛追に防戦一方の岩元…。万事休す!!　窮地に陥った岩元の前に、思いがけぬ人物が現れ!?　最大戦力“大英帝国”との戦いが始まる――!!

岩元の“先輩”奥秋は、箱を抱え旅する不気味な男“怪奇箱男”の行方を追っていた。奥秋の要請を受け、渋々ながらも捜査に協力すべく温泉郷“湯湯酒姫”へとやって来た、岩元と十四人の後輩たち。七つの旅館に分かれ、優雅なひと時を過ごしていた矢先、後輩たちが次々と不可解な異変に巻き込まれ…？　神出鬼没の艶かしき芸者、箱に纏わる曰く付きの旅館――謎解きを急ぐ岩元と奥秋に、更なる怪異が迫る!!

東京監獄で、人間が次々に歯車と化して消える事態が発生。岩元は、その元凶と目される死刑囚・神草の元を訪れる。絞首刑の執行を目前に控えてなお、不気味に笑う神草。神草が投獄される端緒となった殺人事件に違和感を覚えた岩元は、仲間達の協力を得て真相の究明を急ぐが…!?　日本各地に降り注ぐ“隕石”、神の目の“念写”と“忌み家”――奇妙な事件の数々が、能力者との出逢いへと誘う!!　謎めく風鈴売りの少女と岩元の邂逅を描く番外編も収録。

麗しき聖導女学院で、謎の集団食中毒事件が発生。岩元ら栖鳳中学の面々は、女学生たちの警護を任される。事件の陰で囁かれるのは、おぞましき“毒男”の噂――。かつて、毒を操る能力者の少年が軍の施設から逃走した。軍の解剖により内臓を抉り取られた少年は、空洞の腹から汁をしたたらせたまま、少女の血を求め続けるという…!!　事件を調査中、妖しき美少女・瑠璃と出会った岩元。少女たちをも虜にする瑠璃の美貌に秘められし“毒”とは!?

遠く倫敦にまでその名を轟かせ、稀代の天才と謳われた人形師・迦楼羅とその人形が消息を絶った――。岩元の後輩で人形を深く愛する淡魂は、二年前にこの噂を聞いて以来、迦楼羅作の人形を探し続けていた。そのあまりの熱心さに、淡魂の身を案じる岩元だが…!?　橘城先生が遭遇した、異界へと通ずる“昇降機（エレベートル）”の怪。原町が旧友と共に挑む、生徒を夢幻へ誘う“学校の怪談”。次々と現れる能力者の中で、岩元の“推薦”を受けるのは!?

人間の肉体や臓器を石化し、装飾として使用した世にも悍ましきアンティーク家具が存在するという――。“前線部隊”の三年生・権藤は、陸軍の密偵任務で古道具を探し回る不気味な男と“その家具”に遭遇する。岩元は権藤の頼みを受け、家具のオークション現場へ潜入。再び現れた男は、家具に埋め込まれ、石化した人体を“能力”で肉体へと戻していく!!　家具と男に秘められた、恐るべき計画とは!?　海を渡り、新たな脅威が迫る!!

佐々眼や淡魂と共に、“腸詰男”ブルストマンによる大能力者“十三夜の風”復活を阻止した岩元。能力者たちを“兵器”とみなすドイツ帝國の役人に対し、岩元が“仲間たち”への崇高なる想いを示す!!　一方、怪談を追う原町は二年生の烏賊谷を伴い、人心を狂乱させる「蹴鞠男」の謎に迫っていた…!!　日本國内でも新たな勢力が蠢き始める中“休暇”に訪れた僻地で、岩元を待つ悍ましき再会とは!?

怪奇な事件と共に紐解かれる“岩元”の過去――。当時一年生の奥秋は「“火の華”を咲かせる少年」の調査に赴いた先で、五年生の“先輩”と出会う。数奇な運命に翻弄される“火の華”の少年の美貌に魅入られた“先輩”は、少年を匿いながら旅をしていた。能力者への理解がいまだ進んでいない時代にあって、二人は安住の地を求め橘城先生に保護を求めるが…？　岩元胡堂という男に隠された禁忌がいま明かされる!!