強力打線の坂田高校を6対4の接戦で降し、甲子園に甲斐孫六（かいまごろく）旋風を巻き起こして、大阪のワル校・浪城（なみしろ）高校が準決勝進出!!　そして、関西と関東のワル校対決が実現。対するは、神奈川県一のワル校・浜虎（はまとら）学園。浜虎は、エースの由比（ゆい）をボスにした、ラフ・プレー・チーム。よりによって対決前夜、夜の繁華街で前哨戦が行われていた両校――。荒れるぞ、この一戦!!

甲子園に吹き荒れる孫六（まごろく）旋風は、準決勝戦で極悪・浜虎（はまとら）学園を相手に猛威を振るい、完全撃破!!　しかし、翌日の決勝戦は負傷退場した正捕手・永淵（ながふち）と鮫州の2人を欠く事に。なんとか出場した山形も、実は全治3週間のケガを負っていた……。正に満身創痍の浪城（なみしろ）高校。しかも対戦相手は、今大会、打率8割2分を誇るスラッガー・藤堂を擁する北海道・北王学園。どうする、孫六!?

息詰まる甲子園・決勝戦。大阪・浪城（なみしろ）高校対北海道・北王（ほくおう）学園の試合は、早くも5回裏。左手を負傷しながらも、右手にキャッチャー・ミットを持ち替えて復帰した正捕手・永淵（ながふち）のお陰で全力投球が出来る孫六（まごろく）。しかし、そんな永淵のガッツのかいもなく、頼みの「孫六ボール」が藤堂にホームランを喫し、点差は4点になってしまう。浪城のピンチは更に続き……!?

延長戦の末、北王学園・藤堂を三振に打ち取るも、次打者にサヨナラ・ホームランをくらった甲斐孫六（かいまごろく）……。惜しくも甲子園優勝を逃がし、口惜しさで荒れに荒れる孫六だったが、予想外のビッグ・ニュースが飛び込んで来る!!　孫六と正捕手・永淵（ながふち）が揃って、ハワイ遠征軍に選ばれたというのだ。新天地ハワイで、孫六が復活する……!?　日米の猛者が集う、親善野球編、開幕!!

ハワイでの日米野球決戦に臨むも、試合前のいざこざが災いして先発を外された甲斐孫六（かいまごろく）。始まった第1戦。フォークの得意な中条が先発を務め、三振の山を築く……かに見えたが、4番打者・ドンセージに痛烈な場外ホームランを浴びてしまう。1点をリードされ、押され気味の全日本は無死満塁のピンチに。その時、遂に孫六が登板。しかし、ドンセージへの第1球が頭を直撃する死球（デッドボール）となり……!?

全日本軍vs.全ハワイ軍の第1戦は、敵チームのエース、ドンセージのスモークボールによって孫六が三振を喫するという、全日本軍不利の展開に。しかし、執念を燃え上がらせた孫六の起死回生の一打により、3対3の同点に追いつく。そして、7回表。強打者・ドンセージに対し怒りの孫六ボールが唸りを上げ、みごと三振に打ち取る!!　その後は、孫六とドンセージ、両者一歩も引かない奪三振勝負に。果たして、勝者は……!?

第1戦終了後、残り4試合を全てノーヒット・ノーランに牛耳ると孫六が爆弾宣言。そして、第2戦から第4戦は孫六の宣言通りの結果に……。迎えた最終戦。後のない全ハワイ軍は、打倒・孫六の為、全米から選りすぐられた全米選抜（オールアメリカン）を招集。波乱含みで始まった試合は初回から大荒れ。全米No.1の超スラッガー・パイソンが、孫六の剛速球を場外ホームランに――。怒りに燃える孫六はどう出る……!?

全米選抜（オールアメリカン）vs.全日本の第5戦。孫六は、捕手でスラッガーのパイソンのパワーにより2打席連続でホームランを浴びてしまった。これでスコアは、6対0に――。しかし孫六は、パイソンの第3打席は顔面で打球を受けてホームランを防ぎ、打っては、全米No.1投手・オーエンスから1点差に迫るホームランを奪った。オーエンスをマウンドから引きずり落とし、ここから、全日本の怒涛の反撃が始まる……!!

日米親善試合、5戦5勝。うちノーヒット・ノーランが3試合。華々しい戦績で意気揚々と日本への帰路に着いた孫六達。だが、大阪の浪城（なみしろ）高校で待ち受けていたのは盛大な祝賀ではなく、孫六達が留守の間に転校してきて浪城を支配下に治めようとしていた比留間（ひるま）兄弟の陰謀だった――。卑劣な手段で、鮫州と朝田、山形達が次々に血祭りにあげられ、そして、兄弟の魔手は孫六に伸びる……!?

真剣の日本刀で挑みかかる比留間次男（ひるまつぐお）を、木製バットで返り討ちにした孫六。なんとしても孫六を倒したい比留間兄弟は、本拠地・神戸では敵対しているカンフーの「魔王」、劉黒峰（りゅうこくほう）を刺客として呼び寄せた。そして、三男（みつお）と共に現われた劉に対し、孫六の火責めの挨拶が炸裂！　しかし、劉は三角跳びで躱し、両者譲らず全くの五分と五分。いよいよ両雄の戦いが始まる……!!